中队司令负责指挥一个舰艇中队。他同时也是中队中一艘舰艇的舰长，他在他指挥的舰艇的舰桥上领导整个中队。一个典型的中队应该有三艘宇宙飞船，其中包括司令的那艘。

当作战舰队司令决定部队的整体战术时，中队司令的人物就是决定他率领的中队的阵型和机动。

舰长（Captain）

舰长负责指挥一艘舰艇。在舰队组织体系中，他是地位最低的队列军官——在他自己的船上，他是至高无上的指挥官。在一艘大得超乎想象、有数万名男女乘员的飞船上，舰长的地位是最荣耀、最受人尊敬的。对于飞船船员来说，舰队的高级官员离他们实在太遥远，舰长在船上就是皇帝的声音、权威的象征。

非法航运（IllegalShipping）

帝国实在太大了，大得只要你确实想把自己藏起来，你就躲得起来。内政部对恒星际航运控制得十分严密，可尽管如此，依然有非法恒星际飞船存在。这些飞船由未注册的商人、走私犯，甚至干脆是海盗拥有并营运。这是个把脑袋拴在腰带上的活计，因为任何未注册的船只都会自动被海军视为敌人。

比起合法注册的船只，非法船只有相当多的缺点。导航者从整体上来说都是忠诚的帝国公民，他们也非常稀少。恒星际导航要是没有导航者，一次最远也只能跳跃四五光年，远远比不上有了导航者的航行（有了导航者，一次最远可跳跃五千光年）。确实也有导航者会为非法船只工作的，但这样的导航者实在太罕见了。因此绝大部分非法恒星际航运只能局限在它们的基地周围，通常只能在一组距离很近的区以及它们之间的蛮荒地带之间进行。

未注册船只

有许多理由能解释是什么吸引了船长去驾驶一艘非法船只。所有的行星都有各自的法律，规定哪些东西能进出口，哪些不能。有些行星政府全盘负责进口，或是有着严格的检疫法律，官方船只的货物与乘客都要接受仔细的检查并记录在案。许多航线要么为世袭商船船长所垄断，要么根据舰队契约被独占。

各种各样的人（包括帝国指挥官）想要绕过这些障碍。哪怕是注册船只，当要价太高时，偶尔都会想破坏法律，但这样做要冒的风险实在太大了，因为他们的船只很容易被识别出来。

非法船只的基地所在都是秘密，每隔几个月，船长就要改变基地的位置。帝国指挥官也会对非法航运睁一只眼闭一只眼，只要非法航运对他有利。非法商船的最大敌人是背叛！

海盗船（PirateShip）

星际海盗船的活动方式跟未注册商船一样，但他们的意图要危险得多。没几个帝国指挥官愿意在自己的星系里窝藏海盗，所以大部分海盗的基地都设在无人居住的星系里。一些海盗专门针对合法航运下手，也有些海盗则不那么挑食。海盗与非法商船经常会合作，共享情报，有时还会使用同一套设施。

海盗常用的袭击方式是在星系的跳跃点上等待，当目标离开星系时，伴随它的只能进行星系内航行的飞船就会掉头返航，这是海盗就会登上这些飞船，在恒星际飞船跳跃之前抢光货物。尽管海盗也可以击毁一艘货运船，但很少会有海盗真的这么做。

敌军私掠船（EnemyRaider）

私掠船是隶属于敌军的星际飞船。当然啰，谁是敌人，这要看你站在哪一边！帝国指挥官们往往会与邻居发生争执，在争执中，其中一方可能会雇用非法商船甚至海盗去攻击并破坏对方的航运。这种战斗很常见，但被严格控制在仅仅攻击对方的星系内飞船，对于一个帝国指挥官来说，攻击帝国舰队的舰艇是极度愚蠢的！谁要是真敢这么做，他就会立刻遭到毫不留情的报复。不用说，犯了这种错误的帝国指挥官会发现他们自己将在帝国行星打击部队（ImperialPlanetaryAssaultunit）的攻击中灭亡。

帝国舰队会遭遇到的另一类敌军私掠船是外星人的，其中最常见的是蛮人、灵族和虫族的。大部分与外星人发生的战斗规模都比较小，双方都只有几艘船参战。有时双方强大的舰队之间会爆发大战。战争将扩大到相邻的几个星系，并持续几年乃至几十年才会结束。

目前进行的最大规模的战争是抗击克拉肯虫巢舰队（HiveFleetKraken）的战争。虫族舰队威胁到了银河中所有的种族，在虫族贪得无厌的侵略中，它们吃光了被它们征服的行星上的生物。银河西南旋臂几乎已经陷落于虫族之手。

敌军私掠船中还有一类是混沌舰队。混沌舰队的成员是在何露斯叛乱之后逃入恐怖之眼的叛国者。一万多年来，这些被帝国驱逐的叛国者退化的后继者们不断地进行着反对人类的战争。他们有规律地对帝国发动小规模掠袭，有时会发动更大规模的入侵。

一次典型的航行

一次典型的恒星际航行，通常由停泊在帝国的一个世界的轨道上的货运船开始。小型航天飞机忙碌地把稀有矿产、粮食、乘员与人造产品从行星上运往货船，装载过程要花上几周到几个月，其间航天飞机将会反反复